Merhabalar
Protein dinamiği ile ilgili yazımda Protein Data Bank'ın (PDB), protein yapısı ile ilgili biyoinformatik çalışmalarda kullanılan en önemli veri tabanlarından olduğunu söylemiştim. Bu yazımda sizlere PDB'nin neler içerdiği, bir PDB dosyasının yapısının nasıl olduğu gibi konularda bilgi vereceğim.
Öncelikle veritabanını açıklayarak temelden girelim. Veritabanları, teknolojinin gelişmesiyle orantılı olarak
artan bilginin depolanması ihtiyacına karşılık geliştirilen, birbiriyle alakalı
verilerin kullanılabilecek şekilde depolandığı sistemlerdir. Biyolojik
veritabanları ise veritabanlarının bilimsel deneylerden, literatürden, yüksek
çıktılı teknolojiden ve hesapsal analizlerden elde edilen verilerin depolandığı
özelleşmiş kısmıdır. Biyolojik veri tabanları genomik, proteomik, metabolomik ve
mikrodizi gen ifadesi gibi araştırma alanlarından bilgiler içerir.
